鑑於發展生技醫藥需要一個跨部會的單位落實推動工作，因此行政院在1995年11月核定「經濟部生物技術與製藥工業發展推動小組設置要點」，1996年2月依據行政院台84經39257號文正式成立「經濟部生物技術與製藥工業發展推動小組」，以執行並推動生技醫藥產業發展政策，作為各部會溝通、協調、整合之橋樑。2001年11月行政院核定修正名稱為「經濟部生物技術與醫藥工業發展推動小組」。應經濟發展諮詢委員會議(簡稱經發會)產業組共識，2001年12月成立「行政院生物技術產業單一窗口」，辦理生技醫藥產業發展相關諮詢服務及廣宣工作，以建立完整之生技醫藥產業發展環境。民國100年12月9日應行政院組織改造及生技醫藥產業現況之變動，核定修訂小組名稱為「經濟部生技醫藥產業發展推動小組」，簡稱「生醫推動小組」。
 

經濟部生醫推動小組由經濟部產業發展署署長擔任召集人，並由行政院衛生署、環境部(原環境保護署)、國家發展委員會(原經濟建設委員會併入)、國家科學及技術委員會(原國家科學委員會)、農業部(原農業委員會)、國家科學及技術委員會科技辦公室(原科技會報)、國家發展基金管理會(原行政院開發基金管理委員會)、經濟部產業技術司(原技術處)、智慧財產局等相關政府單位、主要研究機構及企業界之代表或學者、專家等組成該小組之委員會，成為一跨部會之業務推動單位。經濟部生醫推動小組致力於成為國內外產業及資訊的交流窗口，並積極推動國內產業投資、整合，協助突破產業發展瓶頸，促使生技醫藥產業加速發展升級，並推動我國成為亞太地區生技醫藥產業之研發、製造及營運中心，進而向全球運籌管理中心邁進。